Das Mädchen Totto-Chan ist anders als die anderen Mädchen und kann und will sich auch nicht anpassen. Daher wird sie in Totto-Chan: Das kleine Mädchen am Fenster ihrer Grundschule verwiesen und von ihrer Mutter in der Tomoe Gakuen, einer alternativen Schule, deren Klassenzimmern in alten Eisenbahnwaggons untergebracht sind, angemeldet. Der gutmütige Schulleiter Sosaku Kobayashi schafft es, auch in der schwierigen Zeit des 2. Weltkriegs, eine angenehme Lernumgebung zu gestalten, in der die Kinder wachsen können.
