لقد مرت سنتان ونصف منذ أن غادر ناروتو أوزوماكي كونوهاغاكوري، قرية هيدن ليف، للتدريب المكثف بعد الأحداث التي غذت رغبته في أن يكون أقوى. والآن يقترب أكاتسوكي، المنظمة الغامضة لنخبة النينجا المارقين، من خطتهم الكبرى التي قد تهدد سلامة عالم الشينوبي بأكمله. على الرغم من أن ناروتو أكبر سنًا وأن الأحداث الشريرة تلوح في الأفق، إلا أنه لم يتغير كثيرًا في شخصيته - لا يزال هائجًا وطفوليًا - على الرغم من أنه الآن أكثر ثقة ولديه تصميم أكبر على حماية أصدقائه ومنزله. مهما كان الأمر، سيواصل ناروتو الكفاح من أجل ما هو مهم بالنسبة له، حتى على حساب جسده، في استمرار القصة حول الصبي الذي يرغب في أن يصبح الهوكاجي.