Command & Conquer: Alarmstufe Rot 2 versetzt das Spielgeschehen weg vom Tiberium-Krieg der Zukunft, hin zu einem alternativen Ausgang des Kalten Krieges. Mit absurden Waffen, Wetter-Kontrolle, Killer-Kraken und Hypnose starten die Sowjets eine Invasion auf die USA.