Frontex ist derzeit Gegenstand von Ermittlungen einer anderen EU-Institution, nämlich von OLAF.
Die Anti-Korruptionsbehörde geht Vorwürfen nach, Mitarbeiter von Frontex hätten Migranten durch Schikanen, Drohungen und ungesetzlichen Verhaltens daran gehindert, europäische Küsten zu erreichen.