É la voce di Krusty il clown nella serie animata I Simpson, ha curato la direzione di doppiaggio di telefilm e film TV ed è tuttora uno dei maggiori adattatori per quanto riguarda l'animazione giapponese. Sua la voce di Eros nel doppiaggio della serie nipponica C'era una volta... Pollon.
Suoi i dialoghi italiani di serie come Bayside School, Queer as Folk, Ranma ½, Beverly Hills 90210, Angel, Party of Five.
Mazzotta ha svolto anche l'attività di autore e disegnatore di fumetti, pubblicando storie su diverse riviste del settore tra le quali Topolino, Lupo Alberto e Cattivik (dove contribuiva con la strip Horror Fix).
È ospite fisso nel programma Cosplayers, in onda su Music Box Italia (canale 821 di SKY).
Fabrizio Mazzotta fa parte di ADAM Italia, associazione che chiede di impedire la censura negli anime.
Ha diretto il doppiaggio di Evangelion: 1.0 You Are (Not) Alone, Mawaru Penguindrum e curato i dialoghi di Mobile Suit Z Gundam.
La sua attività di doppiatore è iniziata da giovanissimo negli anni '70. Fra i suoi primi doppiaggi quello di Danny nel telefilm La famiglia Partridge.
Inoltre insegna doppiaggio presso la scuola di doppiaggio Voice Art Dubbing.