Kurangnya perhatian pemerintah setempat dan kesadaran masyarakat yang sering membuang sampah sembarangan, membuat Pelabuhan Laut Sorong, dipenuhi sampah plastik.
Sampah-sampah yang mengapung di atas air laut Dermaga Sorong ini didominasi, sampah plastik kemasan makanan dan botol minuman. Sejauh ini belum ada upaya pembersihan dari pihak terkait, namun sesekali ada pengepul sampah yang mengangkut beberapa sampah itu. Jika hal ini terus dibiarkan, akan mengganggu kehidupan ekosistem laut.