Los diputados Rafael Larreina, Jon Iñarritu y Xabier Mikel Errekondo han presentado un recurso de amparo ante el Tribunal Constitucional contra la resolución de la Mesa del Congreso de los Diputados que negó a Amaiur la posibilidad de contar con grupo propio en esta Cámara. En la actualidad, forma parte del Grupo Mixto porque en las elecciones consiguieron el 15% de los votos en los territorios en los que se presentaron, pero le faltaron unas décimas en Navarra. Errekondo asegura que la decisión "no está justificada" y dice que dirigentes del PP "reconocieron que el criterio aplicado" fue "exclusivamente político" .