Penemuan bangunan yang diduga struktur candi, berawal dari ketikdaksengajaan, saat warga bersama juru pelihara Candi Ngempon menggali lahan mencari sumber air.
Saat mencapai kedalaman sekitar 3 meter, warga menemukan tumpukan bebatuan.
Balai Pelestarian Cagar Budaya Jawa Tengah, meminta untuk melakukan pengalian yang lebih luas sepanjang 2 meter.
Dari penggalian, kembali ditemukan struktur batu yang masih menyambung dan menemukan umpak yang menyerupai struktur candi.