Huit ans ont passé depuis la débâcle de la sociéte InGen et l'incident de San Diégo. Les dinosaures vivent en totale liberté sur Isla Nublar et Isla Sorna. Le paléontologue Alan Grant, rescapé du carnage de Jurassic Park, fait la connaissance de Paul et Amanda Kirby, qui lui proposent de financer ses recherches contre un survol d'Isla Sorna. D'abord réticent, Grant finit par accepter et prend les airs avec son jeune assistant, Billy Brennan. Mais Grant ne tarde pas à comprendre que la motivation des Kirby est de retrouver leur fils Eric, âgé de 13 ans, qui a disparu quelques semaines plus tôt. L'expédition tourne au cauchemar avec la première attaque d'un dinosaure. L'équipe rejoint précipitamment l'avion mais, manquant l'envol à cause d'un dinosaure géant ;le spinosaure, l'appareil se crashe en pleine forêt...
