No ano de 20XX, Blues demonstra ter se tornado um cruel robô. Sobre o seu comando, vários outros robôs começam a atacar a cidade! Durante o ataque, Blues vai até o laboratório do Dr. Right e o sequestra, deixando pra trás o seu lenço vermelho, que é encontrado por Rockman. Dr. Cossack, para ajudá-lo no resgate de Dr. Right, intensifica o poder do Rock Buster e constrói um passáro robótico chamado Beat.
E assim começa Rockman 5.
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