Die Teenage Mutant Ninja Turtles Raphael (Alan Ritchson), Michelangelo (Noel Fisher), Donatello (Jeremy Howard) und Leonardo (Pete Ploszek / Stimme: Johnny Knoxville) sehen sich mit einer noch größeren Gefahr konfrontiert: Diesmal müssen sie es nicht nur mit Erzfeind Shredder (Brian Tee) aufnehmen, sondern auch mit seinen mutierten Handlangern Bebop (Gary Anthony Williams) und Rocksteady (Stephen Farrelly) sowie dem wahnsinnigen Wissenschaftler Baxter Stockman (Tyler Perry) und dem Alien-Kriegsherrn Krang (Stimme im Original: Brad Garrett). Glücklicherweise steht den humanoiden Schildkröten weiterhin Reporterin April O'Neil (Megan Fox) zur Seite. Zudem finden sie einen Verbündeten in Casey Jones (Stephen Amell), der mit einem Eishockeyschläger bewaffnet auf Verbrecherjagd geht, in diese Rolle aber erst noch hineinwachsen muss. Mit der Zeit gewinnen die Turtles auch das Vertrauen der Polizeichefin Rebecca Vincent (Laura Linney)…