أزاح قرار الخرطوم فتح الحدود بين السودان وجنوب السودان كثيرا من الأعباء بين الشعبين، ويرى مهتمون أن فتح الحدود قد يطوي ملفات عديدة ظلت عالقة بين الطرفين.
