Simon est en vacances chez son grand-père. Cette nuit-là, le grand-père geint car il souffre terriblement. Le nounours, grâce à la panoplie du «Petit chimiste», fabrique une potion destinée à faire rétrécir Simon pour qu'il puisse pénétrer dans le corps du vieil homme afin de le soigner. Voilà donc l'enfant qui se glisse entre les dents et marche sur la langue. Très effrayé par les papilles gustatives qui lui parlent, il se sauve et rencontre un globule blanc, Globule, qui l'entraîne pour une visite aux cordes vocales. C'est en descendant dans les poumons noirs de goudrons qu'ils rencontrent la petite Alvéole qui décide de les accompagner. Ils partent ainsi à la découverte du cur et de son orchestre.Prisonniers de la vésicule biliaire, ils s'en échappent pour gagner l'estomac.