Prologue Le réveil
Se déroulant neuf ans après les événements de MGSV: Ground Zeroes et la destruction de Mother Base, Snake, Aussi appelé Big Boss, sort d'un coma. Nous sommes en 19**, à une époque où la guerre froide continue d'alimenter les crises mondiales. Motivé par la vengeance, Snake établit une nouvelle armée privée et reprend les armes pour traquer un groupe secret, XOF.
